目前，敏珠林寺共有５３名僧人，其中老僧５人，都在４５岁至７４岁之间；其余均为新僧，最大的３４岁，最小为１７岁。在５３名僧人中除两名分别来自措美县和桑日县外，皆是本地札囊县人。寺院管理机构与多杰札寺一样，设寺管会，由主任、副主任和委员会组成，并行使民主管理。敏珠林寺在提倡或发扬学习藏族文化优良传统方面，依然保持着自己的优势。

　　至于桑耶寺。今日由宁玛派、萨迦派和格鲁派三大宗派主持。在寺内设有宁玛派和萨迦派两家的护法殿，分别供奉着两派最神圣的护法神。这表明了宁玛派和萨迦派同时不仅拥有教派权力，而且担负着维护桑耶寺的尊严和威信不受侵害的使命。然而，桑耶寺在宗教仪式方面则不分主次，无论宁玛派、萨迦派还是格鲁派均享有平等的权力。例如，在桑耶寺内举办宗教活动时，主要采纳信教群众（施主）的意见来选定某派的宗教仪轨。可以说，从寺院自身的角度看，桑耶寺没有鲜明的宗派观念。

　　众所周知，大昭寺是一座在国内外知名度很高的藏传佛教寺院。从历史上看，大昭寺是松赞干布时期兴建的第一批佛殿之一，具有悠久的历史，应该是一座宁玛派寺院。由于大昭寺是全国重点文物保护单位之一，得到国家和地方人民政府的修缮保护，而且寺内供养着闻名遐迩的释迦牟尼佛像，它在广大藏族信教群众心目中占有神圣的地位。因而大昭寺实际上已成为凌驾于藏传传佛教诸多宗派之上的一座圣殿，已经没有宗派之界线。需要说明的是，１４０９年宗喀巴大师在大昭寺内成功地举办第一次声势浩大的传昭大法会，即大祈愿法会，后来格鲁派将举行这一大型法会的传统继承下来，并延续至今。经此为契机，格鲁派便理所当然地成为大昭寺的日常主管者。虽然大昭寺以天时地利人和等因素，成为格鲁派主要管理的一座寺院或圣殿，但就大昭寺本身来说，根本没有宗派之概念。大昭寺里面不仅供奉着各宗派的护法神、主尊佛，而且安置着特别是在宗派众多高僧大德的塑像或壁画，外面四周还建有各个宗派的殿堂，一年四季香烟不断。各个宗派在大昭寺内随时可举办自己的宗教仪式或活动，每年均有数以万计的藏族信教群众来此朝拜，也吸引着海内外大批信徒和游客前来参观游览。桑耶寺、大昭寺和昌珠寺，虽然都是融多种宗派为一炉的综合性寺院，但是在广大宁玛派信徒包括历代高僧大德观念中，则有一种坚定不移的共同看法，这就是上述三座寺院始终是宁玛派的祖寺，在宁玛派这一宗派领域占有颇为重要的地位。